Nuo 1996 metų įstaigoje didelis dėmesys skiriamas sveikos gyvensenos ugdymui. Buvo parengta ir įgyvendinama individuali vaikų sveikos stiprinimo ir fizinio ugdymo programa „Aukime sveiki, stiprūs, saugūs“. 2007 m. ši programa integruota į Klaipėdos lopšelio-darželio „Žuvėdra“ ikimokyklinio ugdymo programą „Aukime sveiki, stiprūs, saugūs“, kuri orientuota į darnų vaiko vystymą(si).

1999 metais lopšelio-darželio „Žuvėdra“ pedagoginė bendruomenė įsijungė į Respublikinės ikimokyklinių įstaigų darbuotojų asociacijos „Sveikatos želmenėliai“ veiklą. Lopšelyje–darželyje „Žuvėdra“ ugdymo procesas orientuotas į sveikos gyvensenos vertybių puoselėjimą. Sukurtos palankios sąlygos sporto salėje ir grupėse. Taikomos tradicinės ir netradicinės vaikų fizinio ugdymo ir sveikatinimo formos: ryto mankštos, kūno kultūros valandėlės, taisyklingos laikysenos ir plokščiapėdiškumo profilaktikos ugdymo valandėlės, sportinės pramogos su vaikais, sportinės pramogos su tėvais, sporto šventės, sveikatos valandėlės, viktorinos sveikos gyvensenos klausimais, teminės sveikatos ir fizinio aktyvumo savaitės, sveikatos mėnuo ir kt.

Ugdymo įstaiga 2009-2010 metais dirbo vadovaudamasi šiomis programomis:

Ikimokyklinio ugdymo programa „Aukime  sveiki, stiprūs, saugūs“ - 2007 m. Tai programa ikimokyklinio amžiaus vaikams nuo 1 iki 6 metų., kurioje numatyta visuminė ugdomoji veikla, aiškūs tikslai ir uždaviniai, atitinkantys įstaigą lankančių vaikų galimybes, orientuota į vaikų poreikius, neprieštarauja šiuolaikinės pedagogikos nuostatoms. Programoje  atsispindi įstaigos specifika, vaikų poreikiai, tėvų ir vietos bendruomenės lūkesčiai. Ugdymo programos dėstymo stilius aiškus, paprastas, turinys suprantamas pedagogams ir tėvams. Ugdymo turinys, metodai, priemonės padeda įgyvendinti iškeltus uždavinius ir aprėpia visų vaikui reikalingų kompetencijų ugdymą(si), numatyti metodai bei priemonės ugdymo turiniui įgyvendinti. Programoje numatyti ugdymo pasiekimų vertinimo metodai, dažnumas, vertinimų pateikimo formos.

„Bendroji priešmokyklinio ugdymo ir ugdymosi  programa“. – V., 2002. Ja naudojamasi priešmokyklinėse grupėse, ruošiant vaikus mokyklai. Įtvirtinamos ir ugdomos įvairios kompetencijos: socialinė, sveikatos saugojimo, pažinimo, komunikavimo, meninė.

„Ikimokyklinio amžiaus vaikų saugios gyvensenos įgūdžių ugdymo programa“. – V., 1997. Šia programa naudojasi visa lopšelio – darželio bendruomenė, nes įstaigoje prioritetas teikiamas vaikų sveikatos stiprinimui ir saugojimui. Sporto salėje  kvalifikuotai organizuojami  sportinės veiklos užsiėmimai, pramogos, šventės, užsiėmimai lauke, užtikrinamas vaikų dalyvavimas miesto sporto šventėse. Atidžiai stebimi vaikai, grįžę po ligos, jiems nustatomas deramas krūvis, atliekami įvairūs tyrimai, vertinami vaikų pasiekimai. Mokslo metais lopšelio-darželio priešmokyklinėse grupėse buvo vykdoma tarptautinė programa „Zipio draugai“,  padėjusi vaikams išsiugdyti kasdieninių emocinių bei socialinių sunkumų įveikimo gebėjimus.